Applications du séquençage à très haut débit n°2
Jeudi 10 mars 2022
15h00 – 17h30
Avec le soutien de
Marina MOLETTA-DENAT, INRAE Transfert
Répondre aux enjeux environnements et santé : des recherches ambitieuses portées par les évolutions technologiques des NGS
Marina Moletta-Denat est chargée de projet à INRA Transfert Environnement, Unité d’INRA Transfert, la filiale de valorisation de l’institut. Cette structure d’interface entre les laboratoires de Recherche publics et le monde – 48 – socio-économique, véritable centre de ressource technologique adossé au LBE, consacre son activité à la mise à
disposition directe de services et de ressources auprès des acteurs du secteur des écotechnologies. Titulaire d’un doctorat en Ecologie Microbienne obtenu en 2005 pour ses travaux portant sur la caractérisation de la diversité microbienne des biogaz au Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnement (LBE, Narbonne) de l’Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), elle intègre ensuite le Centre Scientifique et Technique du Bâtiment
dans le département Santé en tant que responsable du laboratoire de microbiologie moléculaire. Durant 6 ans, elle met en place le laboratoire de microbiologie moléculaire et coordonne des projets de recherche et développement sur le thème de la microbiologie des environnements intérieurs en particulier sur la qualité microbiologique de l’air et la caractérisation moléculaire par séquençage haut-débit des aérosols microbiens. Aujourd’hui chargée de projet à INRA Transfert Environnement, elle propose aux demandeurs des prestations analytiques de microbiologie basées sur les outils moléculaires, notamment, PCR quantitative en temps réel, empreinte moléculaire, indices de diversité, séquençage haut-débit et bioinformatique.
Téo FOURNIER, GenoScreen
Les apports du séquençage long read en génomique :
De la microbiologie à la génétique humaine
Téo Fournier a réalisé une thèse en génétique des populations en 2019 (Université de Strasbourg, équipe du Pr Joseph Schacherer).
Il rejoint les équipes de GenoScreen en 2020 en tant que responsable d’exploitation. Ses principales missions consistent à assurer une veille scientifique et technologique, à développer et implémenter de nouvelles prestations de services appliquées aux technologies de séquençages à haut-débit et aux analyses bioinformatique. La mise en œuvre de ces projets de développement visent à pérenniser la compétitivité de GenoScreen dans l’écosystème génomique français avec un environnement technologique en constante évolution.
Sébastien RENOUF, PathoQuest
Le Contrôle Qualité de la bioproduction par Séquençage haut débit : Rapidité et robustesse des solutions innovantes de PathoQuest
Après un début de carrière consacré à l’essor d’une Spin-Off de l’Institut Pasteur et au développement d’une nouvelle START-UP résultant de cette Spin-Off, Dr. Sébastien Renouf a ensuite été nommé Pharmacien Responsable et Directeur Général Délégué de la société IDM Pharma, période durant laquelle le site parisien a une autorisation FDA, la première en France dans le domaine des Médicaments de Thérapie Innovante (Pre Approval Inspection). Il a ensuite rejoint le groupe LFB pour travailler à la création d’une nouvelle filiale dédiée au développement et à l’industrialisation de plusieurs Médicaments de Thérapie Innovante (MTI) via des partenariats public/privé au sein d’un consortium appelé C4C. Sous l’impulsion de ce consortium, la société CellforCure futur CDMO a été créé au sein du groupe LFB en 2010. Sébastien a alors conduit la fabrication de médicaments expérimentaux en tant que Quality Head et Pharmacien Responsable alors que CellforCure se spécialisait de plus en plus dans la fabrication de CART Cells et d’IPS jusqu’en 2018 date à laquelle la société CellforCure a été cédée par l’état au groupe privé Novartis. Sébastien a alors accompagné Novartis pendant presque 2 ans sur une démarche d’accréditation de la société pour la fabrication de produits CART commerciaux concernant les autorisations réglementaires (AMM) et qualité (Inspection).
Début 2021, il a créé un cabinet de consultant indépendant afin d’accompagner un porte feuille de clients sur le développement de MTI. Il assure également des audits et formations sur les GMP et la qualité.
Sébastien rejoint à présent la société pharmaceutique PathoQuest en tant que Pharmacien Responsable et Directeur Général Délégué.
Bouchera DOUAH et Emeric ROUX, Thermo Fisher Scientific
Applications du NGS, du microbiome au metabarcoding
Le pouvoir de notre solution AmpliSeq au service d’IonTorrent déterminant la qualité de l’air, le suivi d’une bactérie à travers son hôte
Notre mission vous accompagner dans vos projets Séquençage Haut Débit pour toutes les applications de l’humain à l’environnement .
Alex DAJKOVIC, Design Pharmaceuticals
High-throughput discovery of novel ligands of G-protein coupled receptors using the PRESTO-SALSA platform
Alex has more than 15 years research and project management experience in biology after obtaining his PhD in microbial cell biology at the University of Kansas Medical Center in Kansas City, USA. His scientific publications have over 700 citations and he has authored 12 patents. At Design Pharmaceuticals he is involved in defining, developing, and overseeing the execution of projects in the human microbiome and in vitro pharmacological assays for discovery of novel ligands for G-protein coupled receptors.
Paul DORAN, Twist Bioscience
The versatility of low pass sequencing in agrigenomic applications
Paul joined Twist Bioscience in 2021 through the acquisition of iGenomX, where he led efforts in business development, sales and operations. Previously, he was Director of Sales and BD at NRGene, a big data company that was first to assemble the wheat genome and to commercialize pangenome databases. Over the past 25 years, Paul had roles in sales, BD and market development at Cellular Dynamics, Agena Bioscience, Affymetrix, and Life Technologies, all companies at the forefront of dramatically increasing our understanding of genomics. In 2003, Paul worked with Mayo Clinic and UTHSC Houston to secure funding for NHLBI’s 1st SNP based GWAS study. Prior to joining the biotech industry in 1994, Paul did molecular biology research at the USDA’s Cereal Rust Laboratory and in Pulmonary Medicine at University of Minnesota.
